Best Male: Justin Timberlake
Best Female:Christina Aguilera
Best Album: Red Hot Chili Peppers — Stadium Arcadium
Best Group: Depeche Mode
Best Pop: Justin Timberlake
Future Sound:Gnarls Barkley
Best Rock: The Killers
Best Alternative: Muse
Best Video: Justice vs. Simian — "We Are Your Friends"
Best Hip Hop: Kanye West
Best R'N'B: Rihanna
MTV Select: Finley
Dopo un'edizione straordinaria a Lisbona, nel 2006 gli Ema abbassano un po' il livello. Cambio generazionale fra gruppi rock e star del pop...Rihanna inizierà ad essere onnipresente al posto di Britney, e Justin apparirà per l'ultima volta prima di essere sostituito da Bieber..
Justin Timberlake — "SexyBack / My Love / LoveStoned"
Muse — "Starlight"
Rihanna — "SOS"
Nelly Furtado — "Maneater"
The Killers — "When You Were Young"