I ragazzi che sono scapati al labirinto sono stato prelevati da degli uomini e portati via in elicottero; Thomas e i suoi compagni si ritroveranno ad affrontare una nuova sfida, si ritroveranno nella zona bruciata all'interno di una struttura che è gestita dalla misteriosa organizzazione chiamata WCKD, qui gli viene detto che sono al sicuro, ma i ragazzi non ci credono e cominciano a cercare indizi fino a quando non troveranno i loro amici, che credevano morti, in una sala a fare da cavie.
A quel punto i ragazzi decidono di fuggire, e una volta fuori cammineranno per la zona bruciata fino ad incontrare la resistenza e con il loro aiuto affronteranno la WCKD e sveleranno i loro sconvolgenti piani che avevano per loro… Per maggiori informazioni: www.20thfox.it