Inoltre WinUtilities Professional Edition dispone anche di una funzione per la pulizia e la correzione degli errori del registro di Windows, per la gestione delle applicazioni che si avviano con il sistema operativo, per eliminare la history delle pagine web visitate e dei documenti aperti, per proteggere l’avvio dei file eseguibili mediante l’impostazione di una password, per ottimizzare l’utilizzo della memoria RAM, per gestire tutti i processi in esecuzione e per la disinstallazione completa dei software dal sistema.