Il territorio molisano condivise la sua storia con l'Abruzzo, fino alla caduta dell'Impero Romano. Resti di quel tempo si possono ancora osservare a Larino, dove sono stati rinvenuti reperti di mosaici policromi ottimamente fatti.
Tutti i principali centri molisani divennero colonie romane, tra cui Isernia, colonia fin dal 262 a.C. , Venafro, città di origine Augustea, e Bojano, nata durante l'epoca di Vespasiano. E' proprio Bojano a diventare il primo territorio autonomo molisano, il Gastaldato di Bojano che, sotto i Normanni, diverrà Comitatus Molisii.
Provincia di Campobasso.
Campobasso.
Nuovo Museo Provinciale Sannitico
Museo Internazionale del Presepio in Miniatura "Guido Colitti"
Museo dei Misteri
Galleria di Arte Contemporanea Limiti-Inchiusi
Altri.
Museo Civico, Baranello
Museo Civico Archeologico e Paleontologico, Bojano
Museo Civico, Campochiaro
Museo Civico, Larino
Museo Archeologico di Sepino, Sepino
Museo d’Arte Contemporanea, Termoli
Museo Diocesano di Arte Sacra, Trivento
Provincia di Isernia.
Isernia.
Museo Paleolitico
Museo Nazionale di Santa Maria delle Monache
Agnone.
Museo Emidiano
Museo Internazionale della Campana della Fonderia Pontificia Marinelli
Museo di Arte Sacra
Altri.
Museo della Zampogna, Scapoli
Museo di Tradizioni Popolari e del Costume d'Epoca, San Pietro Avellana
Museo Archeologico, Venafro
Museo Della Pietra "Chiara Marinelli", Pescopennataro