Codice Genesi significa il ritorno dei fratelli Hughes sul grande schermo con un film post-apocalisse complesso e citazionista.

Codice: GenesiThe Book of Eli

Nel 2043, trent'anni dopo una guerra nucleare che ha stravolto gran parte del clima terrestre, vive Eli, un uomo misterioso che si dirige verso la costa occidentale a piedi. Durante il cammino, Eli dimostra allo spettatore di possedere grandi abilità nel combattimento quando affronta e uccide da solo dei pirati della strada che lo avevano attaccato. Bisognoso di trovare dell'acqua, Eli giunge in una città fatiscente costruita con la supervisione del lord del crimine Carnegie, il quale aspira di poter erigere altre città e avere il controllo totale usando un certo libro che sta disperatamente cercando sul suo desolato territorio con i suoi uomini.
Al pub locale, Eli viene attaccato da una gang di motociclisti, ma egli riesce brutalmente a sconfiggerli da solo. Realizzando che Eli è un uomo "colto" come lui, Carnegie decide di ospitarlo, anche se è chiaro l'offerta non è negoziabile. Dopo che Claudia, la compagna affetta da cecità di Carnegie, ha rifornito Eli di cibo e acqua, Carnegie ordina a sua figlia Solara di invaghire l'ospite. La seduzione però fallisce e Eli invece le offre di condividere il suo pasto. Prima di mangiare, Eli le fa recitare una preghiera insieme a lui, e lei nota che egli porta con sé un libro. L'indomani Carnegie viene a sapere sia della preghiera che del libro di Eli e da Solara intuisce che si tratta proprio della Bibbia, quello che sta cercando ovunque. Di sera Eli si reca a riprendere il lettore musicale che aveva chiesto di ricaricare, ma subito dopo viene assalito dai cecchini di Carnegie. Gli uomini rimangono stupefatti nel vedere che i proiettili non uccidono Eli, che sembra essere rinforzato. Così Eli risponde all'attacco e uccide i cecchini per poi fucilare Carnegie alla gamba.
Solara conduce Eli alla riserva d'acqua della città e spera di poter seguire Eli nel suo pellegrinaggio. Eli invece la rinchiude per poter proseguire da solo. Solara riesce a liberarsi, ma viene assalita da due stupratori, venendo tempestivamente salvata da Eli, che abbatte i due malviventi. Mentre continuano a viaggiare insieme, Eli spiega alla ragazza di possedere quella che lui crede sia l'ultima copia rimasta della Bibbia, siccome le altre sono state intenzionalmente distrutte durante la guerra per via della maggioranza di sopravvissuti che la consideravano la vera causa del conflitto. Per questo Carnegie è alla ricerca di essa, credendo di poterla utilizzare per mettere il popolo in ginocchio come una specie di moderno Conquistador. Eli così intende portare questa Bibbia sopravvissuta in un "posto sicuro" ed è stata la sua fede a dargli la forza di compiere tale atto.
Durante il viaggio la coppia s'imbatte nella dimora di George e Martha, due cannibali che li invitano a prendere il tè. Proprio allora Carnegie e i suoi sgherri li raggiungono e nello scontro a fuoco che segue George, Matha e alcuni uomini del criminale muoiono. Carnegie poi cattura Eli e Solara e si fa consegnare la Bibba da Eli minacciando di uccidere Solara, ma dopo essersi impossessato del libro, Carnegie spara a Eli ferendolo a morte e lo abbandona per poi tornare in città. Solara invece si libera e s'impossessa di una macchina per soccorrere Eli, mentre Carnegie e i suoi uomini rifiutano di inseguirla per via del poco carburante rimasto nel loro veicolo. Solara raggiunge Eli, che è in fin di vita, e prosegue il tragitto attraversando il Golden Gate Bridge giungendo ad Alcatraz, dove un gruppo di sopravvissuti civilizzati hanno eretto una fortezza protettiva e stanno preservando la cultura umana. Nel frattempo Carnegie torna a casa sua e, dopo anni di ricerca, aprendo la copia della Bibbia scopre con orrore che è un'edizione in braille. Dopo che Claudia si è rifiutata di leggerla, Carnegie viene afflitto dai dolori della ferita provocata dal colpo di Eli, che si è infettata. Il criminale vede anche il proprio impero andare a pezzi, visto che sta scoppiando una rissa tra i cittadini e un'altra banda criminale. Carnegie è così condannato ad una lenta e dolorosa fine.
Nel frattempo Eli, con le ultime forze che gli rimangono, recita tutti i versi della Bibbia (che ha ormai memorizzato dopo tante letture negli anni) che vengono trascritti da Lombardi, il leader dei sopravvissuti, che quando finisce archivia la nuova Bibbia insieme alla Torah, alla Tanakh e al Corano. Il film termina con Eli che muore in pace mentre a Solara viene offerto di restare con i civilizzati. La ragazza rifiuta l'offerta e torna al villaggio da sua madre portando con sé gli effetti appartenuti a Eli.