Sui nuovi batteri scoperti nel lago di Vostok

L'Istituto di Microbiologia. S.N.Vinogradskogo  -Accademia Russa delle Scienze-

Anomalie magnetiche nel lago di Vostok

Un nuovo batterio o una nuova forma di vita: commento sul recente accertamento di batteri nel lago Vostok       Recentemente mass media russi e stranieri stanno discutendo sulla scoperta di "una nuova forma di vita" nel lago antartico Vostok, tutto ciò comunicato dopo la relazione presentata da Sergey Bulat (Petersburg Nuclear Physics Institute) al Workshop internazionale sulla Astrobiologia di Mosca nel marzo 2013, in base al quale una sequenza nucleotidica " che mostra 86% di somiglianza a quello delle specie più strette " è stato ottenuta da campioni di ghiaccio indigeni. L’Istituto di Microbiologia Winogradsky (Accademia Russa delle Scienze) ritiene necessario commentare i dati presentati. Al momento non ci sono informazioni disponibili sia sui metodi di campionamento che sulla tecnica molecolare utilizzata. Opere precedenti del dr. Bulat non sollevano dubbi che tutti gli esperimenti siano stati effettuati da personale esperto utilizzando approcci adeguati. L’ "86% di somiglianza" si riferisce a 16S r-RNA di sequenza genica, e la "nuova forma di vita" è stata utilizzata perciò dai giornalisti, poiché la sola presenza del gene 16S rRNA indica chiaramente che il nuovo organismo è un procariote. La sistematica dei procarioti consente di identificare linee profonde (phyla) di organismi che si differenziarono presto nella storia evolutiva della vita. Il livello di somiglianza tra sequenze del gene 16S r-RNA dei phyla si ritiene che non supera 85%. Attualmente esistono cinque phyla all'interno del dominio Archeo-batteri, 31 phyla nel dominio batteri, e un certo numero di "divisioni candidate" (da 40 a 70, secondo varie pubblicazioni) in entrambi i domini rappresentati solo da microrganismi incolti, ossia attualmente conosciuti solo dal loro 16S r-RNA, cioè determinate sequenze geniche ottenute da campioni ambientali.   Uno dei compiti più difficili e interessanti della microbiologia contemporanea è la "coltivazione di incolti" - per ottenere colture di laboratorio dei rappresentanti delle nuove divisioni candidate  ad essere considerate incolte. L’esempio maggiormente impressionante è la scoperta di un nuovo phylum archaeal Thaumarchaeota , rappresentanti dei quali sono stati rilevati con tecniche molecolari presenti in numerosi habitat marini, d'acqua dolce e del suolo. Mediante determinati approcci genomici e  utilizzando culture sono stati identificati come nitrificanti e giocano un ruolo importante nel ciclo dell'azoto. Altri esempi  elaborati dall’Istituto di Microbiologia Winogradsky: Caldithrix abyssi isolato da Margarita Miroshnichenko rappresenta una stirpe  scoperta in precedenza in camini idrotermali in acque poco profonde della Grecia, sempre con la tecnica molecolare. La somiglianza di sequenza genica 16S r-RNA di C.abyssi e i loro più stretti parenti del phylum De-ferribacteres è solo l'81%. Altri esempi: la divisione Candidato è stata descritta da scienziati e da ricercatori russi come un nuovo phylum Ignavibacteriae, costituito da un gran numero di cloni onnipresente ambientali 16S r-RNA e due organismi coltivati, uno delle quali, Melioribacter roseus , è stato isolato da due giovani scienziati  Olga Podosokorskaya e il dottor Ilya Kublanov Istituto di Microbiologia Winogradsky. La posizione filogenetica unica di un nuovo isolato o 16S r-RNA clone ambientale non indica che la sua origine è unica, dal momento che nuove divisioni sono spesso scoperti in vari habitat anche non estremi. Secondo i dati del dr. Bulat sito rilevata del 16S rRNA (500-700 bp) appartiene a un rappresentante di una nuova divisione all'interno del dominio batteri, o una nuova classe all'interno delle divisioni candidati OD1 o OR11 descritti nel 2004. I membri di queste divisioni sono molto diffusi nei sedimenti e nelle colonne d'acqua di bacini marini e di acqua dolce boreali e possono quindi sopravvivere a basse temperature negli habitat sia poveri e ricchi di materia organica. Di qui, la scoperta di un nuovo gruppo filogenetico dei batteri, importante  però, non fornisce una forte evidenza della sua origine super-unica (per il lago di Vostok). Inoltre, non fornisce una forte evidenza che il microrganismo è un contaminante scoperto da una fonte fuori dell'area campione.
Non si  può parlare di eventuali microrganismi sconosciuti fino a quando gli scienziati non avranno ottenuto campioni di acqua del lago non contaminati da miscele di idrocarburi o freon, e si conosceranno i materiali utilizzati per le operazioni di perforazione. Si consiglia a tutti di non fare in fretta con gli annunci su "nuove forme di vita" scoperte nel lago Vostok. Valery F. Galchenko, direttore dell’ Istituto di Microbiologia Winogradsky -Accademia Russa delle Scienze-